"התהוות הכנסייה הנוצרית הראשונית" הוא המשך לספרו הקודם של יהושע אפרון: "ראשית הנצרות ואפוקליפטיקה", שיוחד לניתוח ספרי הבשורה (האבנגיליוןים) וספר מעשי השליחים. בספר שלפנינו ממשיך המחבר בניתוח תהליך התהוותה של הכנסייה, כפי שהוא משתקף בספריה האחרים של הברית החדשה ובמקורות נוצריים קדומים נוספים. הוא מקדיש דיון נרחב לאיגרות פאולוס, אדריכל הכנסייה הנוצרית ויוצק אושיות התיאולוגיה הקאנונית הכריסטולוגית, וכן ליתר האיגרות ולחזון יוחנן – האפוקליפסה החותמת את הברית החדשה. הוא דן בסוגיות הקאנוניזציה של כתבי הקודש הנוצריים וסוקר חיבורים פוסט קאנוניים ראשונים. כן מנתח המחבר עדויות היסטוריות וזכרונות הגנוזים בחביוני הספרות התלמודית והמדרשית. את שרשרת הסוגיות נועל דיון בספרות האפוקליפטית ובמגילות קומראן, תוך הבלטת ההבדלים בינן לבין מחשבת ישראל בת הזמן וזיקתן לנצרות.