גיבורו של הספר, מאיר כהן, הוא טייס בדימוס בחיל האוויר הישראלי, המתכנן להתנקש בחייו של יגאל עמיר, רוצחו של ראש הממשלה יצחק רבין. מאיר חש שמאז הרצחו של רבין "הלכה לו המדינה". גלי ההגירה וההתחרדות המיסטית השוטפים אותה מאז, כמו גם השחיתות וההסתאבות המכלות כל חלקה טובה, ממלאים אותו בתחושה קשה ביחס לעתידה של המדינה.
את מררתו ותסכוליו מפנה גיבור הסיפור אל הדמות השנואה עליו מכל – הרוצח יגאל עמיר, אותו הוא מבקש להעביר מן העולם. זו איננה משימה קלה כל עיקר, בפרט כאשר הרוצח יושב בבית כלא, והקורא עוקב אחר תכניותיו, תכנוניו, מעלליו ומשוגותיו של גיבור הספר, המנסה לממש הלכה למעשה את רעיונו האובססיבי.
ברקע ובתוך כל אלה, נרקם סיפורו האישי של הגיבור, המסובך במערכת יחסים בלתי פתורה עם אחיו שנפטר ממחלה ממארת, ובו בזמן מתקשה להשלים עם הפרידה מן השירות המפואר שלו בחיל האוויר. "הרביניסט האחרון", רומן ייחודי, הכתוב בשפה מדויקת וקולחת, הוא סיפור מרתק, הנוגע בקצות עצביה החשופים והכואבים של החברה הישראלית מאז אותו יום מכונן בתולדותיה המודרניים של המדינה – היום בו נרצח ראש הממשלה רבין.